Informations

Est-ce in vivo ou ex vivo ?


Cette question a probablement été posée plusieurs fois, mais je comprends le concept, je ne sais tout simplement pas comment l'appliquer pour cette expérience particulière

Mon objectif est d'utiliser des tomates cerises et de déterminer leur teneur en glutamate après séchage pendant des durées variables.
Cela impliquerait de mettre les tomates dans la centrifugeuse pour en extraire le jus. Pour cette raison, je "prépare" les tomates in vivo (je pense que j'ai besoin d'éclaircissements) mais j'observe la teneur en glutamate en dehors de l'organisme (ex vivo)

Je ne sais pas comment je devrais classer cette expérience (entre in vivo et ex vivo)

L'aide sera grandement appréciée !!! Merci!!


La classification s'applique généralement aux conditions expérimentales. Les conditions expérimentales sont-elles appliquées à un organisme, ou à un organisme moins qu'entier (culture de cellules --> jusqu'aux réactions chimiques en tube à essai) ?

C'est quelque peu subjectif, mais dans votre cas, étant donné que les conditions expérimentales sont le temps de séchage de l'organisme à peu près entier (la tomate), j'appellerais cela une expérience in vivo.

Pensez-y de cette façon, si vous traitez des animaux avec X et examinez Y, il s'agit d'une expérience in-vivo, que vous isoliez ou non des protéines, de l'ADN, de l'ARN, etc.

Maintenant, si vous isolez d'abord des cellules de souris et que vous les placez pour qu'elles se développent en culture cellulaire, puis que vous les traitez avec X pour examiner le même point final, cela est devenu plus ex-vivo.

In vitro, il s'agirait d'isoler une seule enzyme à partir de cellules de souris, de la placer dans un tube à essai et d'examiner sa capacité à réduire certains substrats après le traitement X.

Dans votre cas, si vous isoliez des enzymes de tomates et que vous les utilisiez ensuite dans un tube à essai pour réduire un agent et mesurer l'activité avant et après un traitement donné, ce serait plus ex-vivo et serait allé jusqu'à in-vitro. .

ÉDITÉ: Matt a souligné que j'avais confondu in vitro et ex vivo sur mon continuum et il avait raison.


Cela dépend de votre champ et de sa proximité avec le spécimen indigène. En pratique, in-vivo et ex-vivo sont utilisés pour souligner une différence relative.

  • Si vous êtes biochimiste dans un domaine/domaine de recherche qui utilise habituellement des composants purifiés et reconstitution : in-vivo
  • Si vous êtes biochimiste dans un domaine/domaine de recherche qui mesure habituellement le glutamate dans les tomates non séchées : ex-vivo
  • Si vous êtes biologiste cellulaire : ex-vivo
  • Si vous êtes biologiste du développement : ex-vivo

(De même, la culture cellulaire est généralement considérée in-vivo par un biologiste cellulaire, mais ex-vivo par un biologiste du développement).


Ex vivo

Ex vivo (latin : "hors du vivant") signifie littéralement ce qui se passe en dehors d'un organisme. [2] En sciences, ex vivo fait référence à l'expérimentation ou aux mesures effectuées dans ou sur les tissus d'un organisme dans un environnement externe avec une altération minimale des conditions naturelles. [2] Ex vivo les conditions permettent l'expérimentation sur les cellules ou les tissus d'un organisme dans des conditions plus contrôlées que ce qui est possible dans in vivo expérimentales (dans l'organisme intact), au détriment de l'altération de l'environnement « naturel ».

L'un des principaux avantages de l'utilisation ex vivo tissus est la capacité d'effectuer des tests ou des mesures qui ne seraient autrement pas possibles ou éthiques chez des sujets vivants. Les tissus peuvent être prélevés de plusieurs manières, y compris en partie, en tant qu'organes entiers ou en tant que systèmes d'organes plus grands. [ citation requise ]

Exemples de ex vivo l'utilisation de l'échantillon comprend : [ citation requise ]

  • en utilisant des lignées cellulaires cancéreuses, comme DU145 pour le cancer de la prostate, dans les tests de dépistage des agents anticancéreux
  • mesures des propriétés physiques, thermiques, électriques, mécaniques, optiques et autres des tissus, en particulier dans divers environnements qui peuvent ne pas maintenir la vie (par exemple, à des pressions ou des températures extrêmes)
  • modèles réalistes pour le développement de procédures chirurgicales
  • enquêtes sur l'interaction de différents types d'énergie avec les tissus ou
  • comme des fantômes dans le développement des techniques d'imagerie.

Lire les médias

Le terme ex vivo signifie que les échantillons à tester ont été extraits de l'organisme. Le terme in vitro (lit. "dans le verre") signifie que les échantillons à tester sont obtenus à partir d'un dépôt. Dans le cas des cellules cancéreuses, une souche qui produirait des résultats favorables, ensuite cultivée pour produire un échantillon témoin et le nombre d'échantillons requis pour le nombre de tests. Ces deux termes ne sont pas synonymes même si le test dans les deux cas est « dans le verre ». Les résultats de ex vivo ne s'appliquent qu'à l'organisme alimentant la cellule alors que le in vitro les résultats ne s'appliquent qu'à la lignée cellulaire utilisée. [ citation requise ]

En biologie cellulaire, ex vivo les procédures impliquent souvent des cellules ou des tissus vivants prélevés sur un organisme et cultivés dans un appareil de laboratoire, généralement dans des conditions stériles sans altérations, jusqu'à 24 heures pour obtenir suffisamment de cellules pour les expériences. Les expériences commencent généralement après 24 heures d'incubation. L'utilisation de cellules ou de tissus vivants du même organisme est toujours considérée comme ex vivo. Un largement joué ex vivo L'étude est le test de la membrane chorioallantoïque du poulet (CAM). Dans cet essai, l'angiogenèse est favorisée sur la membrane CAM d'un embryon de poulet à l'extérieur de l'organisme (poulet). [ citation requise ]

Lire les médias

Possibilités d'accès

Obtenez un accès complet au journal pendant 1 an

Tous les prix sont des prix NET.
La TVA sera ajoutée plus tard dans la caisse.
Le calcul des taxes sera finalisé lors du paiement.

Obtenez un accès limité ou complet aux articles sur ReadCube.

Tous les prix sont des prix NET.


La biologie:Ex vivo

Ex vivo (latin : "hors du vivant") signifie ce qui se passe en dehors d'un organisme. Dans la science, ex vivo fait référence à l'expérimentation ou aux mesures effectuées dans ou sur les tissus d'un organisme dans un environnement externe avec une altération minimale des conditions naturelles. Ex vivo les conditions permettent l'expérimentation sur les cellules ou les tissus d'un organisme dans des conditions plus contrôlées que ce qui est possible dans in vivo expérimentales (dans l'organisme intact), au détriment de l'altération de l'environnement « naturel ».

L'un des principaux avantages de l'utilisation ex vivo tissus est la capacité d'effectuer des tests ou des mesures qui ne seraient autrement pas possibles ou éthiques chez des sujets vivants. Les tissus peuvent être prélevés de plusieurs manières, y compris en partie, en tant qu'organes entiers ou en tant que systèmes d'organes plus grands.

Exemples de ex vivo l'utilisation d'échantillons comprend :

  • trouver des agents de traitement du cancer qui sont efficaces contre les cellules cancéreuses de l'organisme
  • mesures des propriétés physiques, thermiques, électriques, mécaniques, optiques et autres des tissus, en particulier dans divers environnements qui peuvent ne pas maintenir la vie (par exemple, à des pressions ou des températures extrêmes)
  • modèles réalistes pour le développement de procédures chirurgicales
  • recherches sur l'interaction de différents types d'énergie avec les tissus ou
  • comme des fantômes dans le développement des techniques d'imagerie.

Le terme ex vivo signifie que les échantillons à tester ont été extraits de l'organisme. Le terme in vitro (« dans le verre ») signifie que les échantillons à tester sont obtenus à partir d'un dépôt, dans le cas des cellules cancéreuses, une souche qui produirait des résultats favorables, puis cultivés pour produire un échantillon de contrôle et le nombre d'échantillons requis pour le nombre de essais. Ces deux termes ne sont pas synonymes même si le test dans les deux cas est "dans le verre". Les résultats de ex vivo ne s'appliquent qu'à l'organisme alimentant la cellule alors que le in vitro les résultats ne s'appliquent qu'à la lignée cellulaire utilisée.

En biologie cellulaire, ex vivo les procédures impliquent souvent des cellules ou des tissus vivants prélevés sur un organisme et cultivés dans un appareil de laboratoire, généralement dans des conditions stériles sans altération, pendant jusqu'à 24 heures pour obtenir suffisamment de cellules pour les expériences. Les expériences commencent généralement après 24 heures d'incubation. L'utilisation de cellules ou de tissus vivants du même organisme est toujours considérée comme ex vivo. Un largement joué ex vivo L'étude est le test de la membrane chorioallantoïque du poulet (CAM). Dans cet essai, l'angiogenèse est favorisée sur la membrane CAM d'un embryon de poulet à l'extérieur de l'organisme (poulet).


Conclusion

Un précis in vivo le modèle de tumeur cérébrale pédiatrique est celui qui peut fidèlement récapituler les caractéristiques histopathologiques et moléculaires de la tumeur présenter une caractérisation spatiotemporelle de la tumeur démontrer un microenvironnement tumoral prédire la réponse des patients aux traitements montrer un taux d'incidence élevé et une latence courte et est reproductible, gain de temps et rentabilité (184). Une telle précision dans les modèles tumoraux peut être obtenue au mieux lorsque les agressions génétiques correspondent à la cellule d'origine et sont introduites à des stades de développement essentiels au développement de la tumeur. Pour efficace in vitro la découverte de nouveaux médicaments contre le cancer, in vitro les modèles de tumeurs cérébrales devraient non seulement récapituler la biologie des tumeurs, mais les méthodes de culture devraient également être adaptées au criblage à haut débit (HTS). Les nouvelles technologies et avec elles les possibilités de plates-formes de dépistage plus complexes peuvent être intégrées pour optimiser les systèmes modèles pour les tumeurs cérébrales pédiatriques. Par exemple, les modèles de cancer du cerveau sur puce récemment développés intègrent plusieurs types de tissus dans des cultures 3D dans un système microphysiologique (MPS) et fournissent un contrôle précis d'un microenvironnement cellulaire et une surveillance en temps réel du comportement et de la réponse cellulaires. Néanmoins, alors que les modèles de cancer du cerveau sur puce peuvent mieux imiter la fonction physiologique du cerveau, des défis demeurent. Les tumeurs cérébrales démontrent une profonde hétérogénéité inter- et intra-tumorale et une plasticité cellulaire pour adapter leurs phénotypes à l'environnement. Avec plus de précision in vitro et in vivo modèles de tumeurs, cependant, il est possible d'améliorer le faible taux d'approbation actuel des médicaments anticancéreux, afin d'offrir plus d'options de traitement pour les patients pédiatriques atteints de tumeurs cérébrales.

Bien que les modèles de tumeurs cérébrales pédiatriques se soient considérablement développés au cours des dernières décennies, il n'existe pas de modèle unique qui réponde à tous les critères et, par conséquent, la conception et l'objectif expérimentaux devront guider le choix du modèle de tumeur cérébrale (22, 24). Les progrès rapides de la caractérisation génomique des tumeurs cérébrales pédiatriques et, avec elle, de nouvelles signatures génomiques de sous-groupes tumoraux ajoutent à la complexité du développement de modèles précis de tumeurs cérébrales pédiatriques. De plus, ces dernières années, le paysage génomique des tumeurs cérébrales pédiatriques, à la fois somatiques et épigénétiques, a été complété par l'analyse des transcriptomes tumoraux. Malgré la pléthore de données générées par de telles approches, la découverte qu'une différenciation altérée de progéniteurs neuraux spécifiques est un mécanisme courant sous-jacent aux cancers pédiatriques (185) permet d'espérer qu'une approche rationnelle du développement in vitro et in vivo les modèles de tumeurs cérébrales pédiatriques peuvent constituer une bibliothèque gérable de plates-formes de recherche pour le développement d'interventions thérapeutiques percutantes pour les cancers du cerveau pédiatriques.


Les scientifiques déverrouillent le «code du sucre» pour réguler la production de cellules souches sanguines in vivo et ex vivo

Les scientifiques de Yale ont identifié un lien biologique crucial dans le processus qui transforme certains sucres complexes en cellules souches et progénitrices hématopoïétiques.

La reprogrammation des cellules en cellules souches et progénitrices hématopoïétiques (HSPC) a été le Saint Graal pour les greffes de cellules souches autologues, une thérapie salvatrice pour les maladies cancéreuses du sang. Cependant, les mécanismes qui régulent cette transition au niveau cellulaire et moléculaire sont mal compris. Une nouvelle étude publiée dans Science identifie le microARN (miR)-223 comme un lien crucial entre les sucres complexes appelés glycanes et la transition endothéliale à hématopoïétique (EHT), un processus par lequel l'endothélium hémogénique se différencie en cellules souches et progénitrices hématopoïétiques (HSPC).

Avancées dans le domaine des cellules souches

Une percée dans la transplantation de cellules souches s'est produite dans les années 1960 lorsque le biologiste Ernest McCulloch, MD et le biophysicien James Till, Ph.D. ont découvert que les cellules souches hématopoïétiques (CSH) ont la capacité de s'auto-renouveler et éventuellement de produire différents types de cellules sanguines. Ces cellules souches peuvent former toutes les lignées de cellules sanguines nécessaires tout au long de la vie.

Un deuxième jalon a été la découverte de biomolécules à base de sucre. Les glycanes spécifiques de la surface cellulaire jouent un rôle important dans la biologie humaine, de la façon dont notre corps reconnaît et combat les maladies à la progression du cycle cellulaire.

"Les progrès réalisés dans la reprogrammation des cellules au cours des cinq dernières années reposent sur des études qui élucident les mécanismes de l'hématopoïèse du développement, où les cellules souches sanguines naissent naturellement à partir de véritables cellules endothéliales aortiques via une transition endothéliale à hématopoïétique. Cette transition des cellules endothéliales aux cellules souches sanguines est hautement régulée et limitée à une petite partie des cellules endothéliales pendant une brève période de temps », a déclaré Stefania Nicoli, Ph.D., professeur agrégé de médecine cardiovasculaire et de génétique et auteur principal de l'étude.

Décrypter le code du sucre

En combinant des techniques analytiques, structurelles et de biologie cellulaire, les chercheurs ont découvert que les protéines à la surface des cellules endothéliales sont modifiées par un "code du sucre" spécifique appelé N-glycane pour limiter leur production sanguine. Cette biomolécule commune limite l'activité des régulateurs hématopoïétiques.

Il y a deux applications potentielles pour cette découverte. Premièrement, il fournit une méthode améliorée pour la production de cellules souches avec une plus grande chance de succès. Deuxièmement, il pourrait avoir une large application pour les traitements contre le cancer, permettant aux scientifiques d'utiliser la glyco-ingénierie pour modifier la surface de la cellule et voir comment elle affecte la progression du cancer.

« Nous pouvons utiliser la génétique ou des produits chimiques pour modifier ce « code du sucre » et changer l'efficacité de la production de sang dans les embryons. Ces découvertes éclaireront les stratégies pour comprendre la production de cellules souches sanguines en laboratoire, qui peuvent être utilisées pour traiter les maladies du sang, comme la leucémie », a déclaré Nicoli.


Analyse des granulés P in vivo et ex vivo

Version corrigée -Cette version peut être citée. Les granules d'ARN sont des compartiments sous-cellulaires dynamiques dépourvus de membranes enveloppantes. Il a été proposé que les granules d'ARN se forment par séparation de phase liquide-liquide, un processus thermodynamique qui sépare les molécules entre les phases liquides diluées et condensées 1 . Les granules P sont des granules d'ARN archétypiques dans C. elegans qui affichent des comportements de type liquide 2 . Nous décrivons ici in vivo et ex vivo approches pour analyser les propriétés matérielles des granulés de P. Nous constatons que la phase liquide des granules de P est stabilisée par une enveloppe enveloppante moléculairement distincte qui est intrinsèquement non dynamique. Conforme à une phase de gel, la coque est résistante à la dilution, à la teneur élevée en sel et aux alcools aliphatiques, et se dissout dans le SDS. La solidification des granules d'ARN a été liée à la dégénérescence neuronale 3 . Nos résultats suggèrent que les polymères de type gel sont des composants essentiels des granules d'ARN qui aident à stabiliser les phases liquides dans l'environnement cellulaire.


Qu'est-ce que la thérapie génique in vivo ?

La thérapie génique in vivo est une technique qui implique la livraison directe de gènes dans les cellules d'un tissu particulier à l'intérieur du corps du patient pour traiter les maladies génétiques. Il peut être appliqué à de nombreux tissus du corps humain, notamment le foie, les muscles, la peau, les poumons, la rate, le cerveau, les cellules sanguines, etc. Les gènes thérapeutiques sont introduits par les vecteurs viraux ou non viraux dans le patient. Cependant, le succès dépend de plusieurs facteurs tels que l'absorption efficace des vecteurs porteurs de gènes thérapeutiques par les cellules cibles, la dégradation intracellulaire des gènes au sein des cellules cibles et l'absorption des gènes par le noyau, la capacité d'expression du gène, etc.

Figure 02 : Thérapie génique in vivo


Conclusion

Un système ex vivo représentatif, fiable et reproductible pour évaluer la puissance de nouveaux traitements pour les os endommagés ou malades n'a pas encore été établi. La création de modèles avancés standardisés est entravée par différents inconvénients des cultures d'explants osseux, notamment une durée de vie limitée en culture statique et l'absence d'activité et de résorption des ostéoclastes, en particulier pour les explants chargés mécaniquement. Pour surmonter ces défis, les futures recherches devraient se concentrer sur l'incorporation d'une charge mécanique dans des bioréacteurs standardisés et sur la recherche de conditions de culture optimales pour permettre aux ostéoblastes ainsi qu'aux ostéoclastes de remplir leurs actions dans le processus de remodelage. De plus, des cultures avec du tissu osseux physiologiquement pertinent, idéalement de gros animaux ou humains, avec des procédures optimisées d'isolement, de culture et d'analyse sont nécessaires pour établir des plates-formes qui pourraient compléter le processus de tests précliniques. Grâce à la préservation de la complexité physique et spatiale, les cultures d'explants osseux pourraient améliorer la traduisibilité entre les études in vitro et in vivo et favorisent notre responsabilité éthique de réduire, affiner et remplacer les tests sur les animaux.


Caractérisation des tissus in-vivo et ex-vivo

Les propriétés précises des tissus biologiques vivants sont d'une importance cruciale pour l'avancement de la science de la simulation médicale. Il existe 2 lacunes clés dans la littérature actuellement disponible qui entravent le développement de simulateurs précis. Premièrement, les données collectées pour certains tissus humains sont minimes et nécessaires aux simulateurs chirurgicaux. Deuxièmement, la richesse des données de caractérisation des tissus collectées sur un large éventail de tissus est largement inutilisable pour le développement de simulateurs haute fidélité car ces tissus ont été testés ex-vivo. Il est bien connu que de nombreux tissus présentent des propriétés radicalement différentes d'ex-vivo à in-vivo. Il existe de nombreuses raisons à ces différences, notamment la perfusion, les variations de température et les conditions aux limites modifiées lors des tests ex-vivo.

Notre recherche vise à répondre à ces deux défis. En partenariat avec les services locaux de donneurs de tissus, nous construisons une base de données des propriétés des tissus humains, avec une attention particulière aux tissus requis pour les simulateurs chirurgicaux. De plus, nous construisons les outils robotiques nécessaires pour mesurer les propriétés des tissus in vivo. À l'aide de ces outils, nous visons à quantifier et à modéliser la dégradation des propriétés tissulaires d'in-vivo à ex-vivo pour divers tissus porcins. Avec un tel modèle, la richesse actuelle des données ex-vivo pourrait être rendue plus utile pour développer des simulateurs précis.


Conclusion

Un précis in vivo le modèle de tumeur cérébrale pédiatrique est celui qui peut récapituler fidèlement les caractéristiques histopathologiques et moléculaires de la tumeur présentent une caractérisation spatiotemporelle de la tumeur démontrent un microenvironnement tumoral prédisent la réponse des patients aux traitements montrent un taux d'incidence élevé et une latence courte et est reproductible, gain de temps et rentabilité (184). Une telle précision dans les modèles tumoraux peut être obtenue au mieux lorsque les agressions génétiques correspondent à la cellule d'origine et sont introduites à des stades de développement essentiels au développement de la tumeur. Pour efficace in vitro découverte de nouveaux médicaments contre le cancer, in vitro Les modèles de tumeurs cérébrales devraient non seulement récapituler la biologie des tumeurs, mais les méthodes de culture devraient également être adaptées au criblage à haut débit (HTS). De nouvelles technologies et avec elles les possibilités de plates-formes de dépistage plus complexes peuvent être intégrées pour optimiser les systèmes modèles pour les tumeurs cérébrales pédiatriques. Par exemple, les modèles de cancer du cerveau sur puce récemment développés intègrent plusieurs types de tissus dans des cultures 3D dans un système microphysiologique (MPS) et fournissent un contrôle précis d'un microenvironnement cellulaire et une surveillance en temps réel du comportement et de la réponse cellulaires. Néanmoins, alors que les modèles de cancer du cerveau sur puce peuvent mieux imiter la fonction physiologique du cerveau, des défis demeurent. Les tumeurs cérébrales démontrent une profonde hétérogénéité inter- et intra-tumorale et une plasticité cellulaire pour adapter leurs phénotypes à l'environnement. Avec plus de précision in vitro et in vivo modèles de tumeurs, cependant, il est possible d'améliorer le faible taux d'approbation actuel des médicaments anticancéreux, afin d'offrir plus d'options de traitement pour les patients pédiatriques atteints de tumeurs cérébrales.

Bien que les modèles de tumeurs cérébrales pédiatriques se soient considérablement développés au cours des dernières décennies, il n'existe pas de modèle unique qui réponde à tous les critères et, par conséquent, la conception et l'objectif expérimentaux devront guider le choix du modèle de tumeur cérébrale (22, 24). Les progrès rapides de la caractérisation génomique des tumeurs cérébrales pédiatriques et, avec elle, de nouvelles signatures génomiques de sous-groupes tumoraux ajoutent à la complexité du développement de modèles précis de tumeurs cérébrales pédiatriques. De plus, ces dernières années, le paysage génomique des tumeurs cérébrales pédiatriques, tant somatiques qu'épigénétiques, a été complété par l'analyse des transcriptomes tumoraux. Malgré la pléthore de données générées par de telles approches, la découverte qu'une différenciation altérée de progéniteurs neuraux spécifiques est un mécanisme courant sous-jacent aux cancers pédiatriques (185) permet d'espérer qu'une approche rationnelle du développement in vitro et in vivo les modèles de tumeurs cérébrales pédiatriques peuvent constituer une bibliothèque gérable de plates-formes de recherche pour le développement d'interventions thérapeutiques percutantes pour les cancers du cerveau pédiatriques.